หลังจากที่เรา Download Package เวอร์ชั่นล่าสุดของ CodeIgniter จาก http://codeigniter.com  มาแล้ว ขั้นตอนการติดตั้งนั้นคุณสามารถทำได้ดังนี

1. แตกไฟล์ package ถูกบีบอัดมาด้วย zip
2. อัพโหลดโฟลเดอร์ CodeIgniter และไฟล์ไปยังเว็บเซิร์ฟเวอร์ของคุณ โดยปกติแล้วไฟล์ index.php จะอยู่ที่ root ของคุณ
3. เปิดไฟล์ application/config/config.php ด้วย text editor และตั้งค่า URL พื้นฐานของ CodeIgniter ที่คุณต้องการติดตั้ง ถ้าคุณต้องการที่จะใช้การเข้ารหัสต่าง encryption หรือใช้ sessions ให้ตั้งค่า key encryption ของคุณ
4. ถ้าคุณต้องการใช้ฐานข้อมูล ให้เปิดไฟล์ application/config/database.php ด้วย text editor และตั้งค่า database ของคุณ

ถ้าคุณหวังที่จะเพิ่มความปลอดภัยโดยการซ่อนตำแหน่งที่อยู่ของไฟล์ CodeIgniter ของคุณ ก็ให้เปลี่ยนชื่อโฟลเดอร์ system ไปเป็นชื่ออื่นได้ ถ้าเกิดว่าคุณเปลี่ยนชื่อโฟลเดอร์นี้ คุณจะต้องเปิดไฟล์ index.php ตัวหลักและตั้งค่าตัวแปร $system_folder ที่อยู่ตรงส่วนบนของหน้าไปเป็นชื่อใหม่ที่คุณได้ตั้งไว้
(แปลมาจากขั้นตอนการติดตั้งของ CodeIgniter )

มาถึงตรงนี้ เราก็พร้อมที่จะใช้งาน CodeIgniter กันแล้วนะครับ ถ้าคุณต้องการจะสร้างส่วนของการแสดงผลหรือ View[/] ให้สร้างไว้ที่
system/application/views/VIEWFILENAME.php

แต่ถ้าหากต้องการจะสร้างส่วนของการควบคุม หรือ Controller ให้สร้างไว้ที่
system/application/controllers/CONTROLLERFILENAME.php

และในทำนองเดียวกันถ้าต้องการจะสร้าง Model เพื่อติดต่อกับฐานข้อมูลให้สร้างไว้ที่
system/application/models/MODELFILENAME.php